L’Association est administrée par un Conseil d’Administration composé de vingt-sept (27) membres maximum élus par l’Assemblée Générale.
Le Conseil d’Administration est composé de deux collèges à voix délibératives :
• Le premier de 18 membres maximum où les administrateurs sont des parents d’enfants et / ou d’adultes accueillis dans une structure de l’Adapei de l’Ain ou accompagnés par un service de l’Adapei de l’Ain, dit le Collège « Parents »
• Le second de 9 membres maximum non-parents d’enfants et / ou d’adultes handicapés, où les administrateurs sont des personnes manifestant un intérêt à la cause du handicap, dit le Collège « Non-Parents ».
Les membres des deux collèges disposent chacun d’une voix et délibèrent ensemble au Conseil d’Administration.